從運營內容上來看，特色小鎮的運營包括特色產業運營、旅游運營及生活服務運營三大體系，詳見下圖。
特色產業運營是特色小鎮運營的關鍵。主要作用，第一，通過全天候的貼身管理服務，實現企業與政府各部門之間的有效對接，從而簡化手續，提高效率。比如幫助企業進行注冊登記、各項審批、營業執照年檢、納稅申報等服務，并幫助企業向政府爭取政策等；第二，根據企業以及產業發展的需求，不斷優化產業結構，尤其是加大對生產性服務企業、研發企業、產業孵化平臺等機構的吸引，構建產業生態體系，促進產業健康發展；第三，通過與各大銀行、保險等金融機構建立良好的合作關系，或自身建立VC類/PE類基金、投資公司等，直接參與企業的投資，或成立擔保公司，對接外來資本，為企業融資提倛擔保服務，從而全方面解決企業融資難的問題；第四，組織行業研討會、產品展銷會、產品設計大賽等活動，以龍頭企業為帶動，成立產業聯盟，通過行業之間的充分交流，不斷塑造自身的產業品牌；第五，優化辦公環境，加強休閑、娛樂、餐飲、商務等配套設施的服務，為產業人員提供良好的工作氛圍。
旅游運營，一般由市場化的運營機構負責，與特色產業運營是兩套體系。以杭州的夢想小鎮為例，杭州未來科技城(海創園)管委會是杭州夢想小鎮產業的管理和運營單位，杭州夢想小鎮旅游文化發展有限公司是杭州夢想小鎮的景區管理和運營單位。旅游運營主要包括小鎮的旅游營銷、品牌培育、景區管理、信息服務、安全管理、數據統計等。
生活服務運營，主要包括兩塊：一是為小鎮居民提供休閑、娛樂、商業、餐飲等一般性生活服務，并根據常住人口的特征，提供高端醫療、俱樂部等定制服務；另一方面是對接城鎮體系，為產業落戶人口及其配偶子女提供職工子女入學、戶口遷移、租賃房屋等服務。
